नन klarissok के लिए मठ 1280 में नीचे मौरा डायस स्थापित किया गया था। मठ लंबे समय तक नहीं किया था, और 1311 में यह अस्तित्व समाप्त हो गया। 1316 में राजा Dinis मैं की पत्नी, पुर्तगाल, बहाल मठ की रानी इसाबेला।

पुर्तगाल की रानी इसाबेला भी उसकी वजह से असाधारण शील और धर्म के "पवित्र रानी" कहा जाता है। उनके अच्छे चरित्र के लिए प्रसिद्ध भी रानी अस्पतालों, अनाथालयों और स्कूलों आधारित है। उसके पति, राजा Dinis की मौत के बाद, वह मठ को सेवानिवृत्त हो गए। और 1336 में रानी की मृत्यु हो गई और गोथिक शैली में सजाया कब्र में मठ में दफनाया गया था। 1626 में, रानी इसाबेला अपने दान और अच्छे कर्मों के लिए संत घोषित किया गया था।

मठ के पहले वास्तुकार Alcobaça के मठ की दीर्घाओं पर अपने काम के लिए जाना जाता डोमिंगोस डोमिंग्स था। उन्होंने कहा कि इस वास्तुकार लिस्बन में दीर्घाओं गिरजाघर पर अपने काम के लिए प्रसिद्ध था, जो Estevao डोमिंग्स का काम जारी रखा। 1330 में, और बाद में चर्च के दक्षिणी भाग के लिए मंदिर के अभिषेक एक मठ का निर्माण किया गया था। मठ बहुत बार नकद दान और उपहार प्रस्तुत किया है। XVI सदी की शुरुआत में, चर्च Sevillian टाइल्स और स्थापित नई वेदियों के साथ सजाया गया था।

मठ और चर्च नदी Mondego के बाएं किनारे पर बनाया गया था के बाद से, फिर एक साल बाद इमारत नदी के जल के बैंकों पर पानी भर गया था। और सदियों के लिए मठ में कई बार बाढ़ आ गई। कारण मठ में अक्सर बाढ़ के लिए यह होना संभव नहीं था, और राजा जॉन चतुर्थ इमारत छोड़ने और एक नया मठ के लिए स्थानांतरित करने का आदेश दिया - नहीं अभी तक पुरानी इमारत से एक पहाड़ी पर बनाया गया सांता क्लारा-एक नोवा के मठ,। रानी इसाबेला और अन्य शाही व्यक्तियों के अवशेष के साथ कब्र नए भवन में स्थानांतरित कर दिया गया।

समय के साथ, खंडहर में पुराने मठ। 1910 में इमारत राष्ट्रीय महत्व का स्मारक के रूप में सूचीबद्ध किया गया है, और कुछ पुनर्निर्माण काम करता है बीसवीं सदी की पहली छमाही में किए गए।